Bu yöntemin en büyük avantajı oldukça doğal ve tespit edilemeyen sonuçlar elde edilmesidir.
Bu işlemin normal FUE yönteminden farkı, Mikro-FUE yönteminde doktorların 0.6 ila 0.8 mm çapında özel bir alet kullanılmasıdır. Bunun sonucunda donör bölgesi ve ekim yapılan bölge doğal gözükmekte ve daha da önemlisi greftlerin yağ bezleriyle birlikte çıkarılması ve saç için hayati elementlerin korunması, saç ekiminin başarısını ve saçların hayatta kalma oranını oldukça arttırmaktadır.